阜康荒漠生态站位于新疆维吾尔自治区昌吉回族自治州阜康市、新疆生产建设兵团直属222团（又称阜北农场），地理坐标北纬44.29103，东经87.93047，站部距乌鲁木齐86公里，阜康站本部占地总面积800亩，其中有土地使用证的315亩，其余为长期租用土地。该站所处地区属温带荒漠气候，夏季炎热而冬季寒冷，年平均气温6.6 ,最高气温6 ，最低气温-41.6 ，七月平均气温25.6 ；一月平均气温-17 ，年降水量164毫米，年蒸发量2000毫米左右，冬季积雪29厘米，无霜期174天。研究地区既有古老绿洲和新绿洲分布，又有保护较好的自然植被，共记录有植物57科369种，脊椎动物150种，其中鸟类94种，兽类37种，其中国家级保护动物25种，如珍贵的黑鹤，雪豹，北山羊和小鸨等。 　　阜康站常规监测研究的范围为东经87 45′-88 05′，北纬43 45′-44 30′。阜康站所在区域，基本具备干旱区所有的生态类型，阜康站距东天山最高峰-博格达峰（海拔5445米）直线距离72公里，距古尔班通古特沙漠南缘（海拔460米）直线距离8公里，以博格达山的冰川到古尔班通特沙漠，形成一个完整的垂直带和水平地理带，包括冰雪带、草甸草原带、森林带、荒漠草原带、戈壁带、绿洲及沙漠。在绿洲中，既有2000年以上灌溉耕作历史的古老绿洲，也有建国以来大量开发的新垦绿洲。而且，上述完整、系统的生态系列，反映在不到100公里的直线距离内，在世界上极其罕见。 此外，阜康站所在的三工河流域是一个独立、完整的小流域，为开展流域内荒漠―绿洲生态系统系统监测，创造了十分方便和理想的条件。阜康站及其研究范围，在世界和中国荒漠―绿洲生态系统中具有典型代表性，是一个研究干旱区生态与环境问题的天然实验室。