该站位于昌吉州木垒县东北，距县城约80 km处，地理坐标：44.04°N ，90.99°E；。该区域处于准噶尔盆地东缘山前洪积、冲积平原，海拔800～1000 m。气候寒冷干燥, 7月平均气温为20°C，1月平均气温为-15°C，年平均降雨量150 mm。土壤以粘质和沙质土为主。研究区中的优势植物为小半灌木－盐生假木贼和蒿群落。此外，零星分布有梭梭和琵琶柴。草本类以一年生植物为主，常见的有角果藜、车前等。 　　目前，木垒站站区占地2500 ㎡ （50 m×50 m的砖砌围墙）。其中2幢砖混结构综合性房屋共计350 ㎡，包括实验室、多功能室、卧室、餐厅、厨房、储藏间、电池房、发电机房等；院内建有10 Kw风光互补电站一套，100 ㎡停车棚，并配有修理间、水井、水塔、公厕、警卫房等其他附属建筑与设备等。