基因组测序文件：菌株SYSU D00978T 的16S rRNA 基因正反序列文件。\n基因组组装文件：使用 Fastp（v0.23.2）对原始读取进行修剪以去除低质量碱基，并使用工具 SPAdes （v3.15）组装产生的高质量序列。
", "ds_source": "在2021 年中国西北旱地微生物多样性研究中，从新疆古尔班通古特沙漠（北纬44°56′，东经88°33′，海拔 654 m）采集的沙质块状土壤中分离出来菌株SYSU D00978T。
", "ds_process_way": "将大约 5 g 原始土壤悬浮在 45 mL 无菌 0.85% 生理盐水中，并在 28 °C 和 180 rpm 下摇动 60 分钟。制备连续 10 倍稀释液，并将 100 μL 等分试样涂布到淀粉酪蛋白琼脂上（SCA：可溶性淀粉 10.0 g/L，酪蛋白 0.3 g/L，KNO3 2.0 g/L，NaCl 2.0 g/L，K2HPO4 2.0 g/L，MgSO4·7H2O 0.05 g/L，CaCO3 0.02 g/L，FeSO4·7H2O 0.01 g/L，琼脂 18.0 g/L，pH 7.2），含有选择性试剂（制霉菌素 50 mg/L、萘啶酸 25 mg/L、放线菌酮 25 mg/L 和重铬酸钾 25 mg/L）抑制真菌和快速生长的细菌。培养基补充了基于国际链霉菌项目 （ISP）的微量盐和维生素，包括额外的钴胺素（0.5 mg/L）和叶酸（0.5 mg/L）。\n将板在 30 ℃下孵育5天，然后通过在改良的 ISP 4 琼脂（可溶性淀粉 10.0 g/L，酵母提取物 4 g/L，（NH4)2SO4 2.0 g/L，CaCO3 2.0 g/L，K2HPO4 1.0 g/L，MgSO4·7H2O 1.0 g/L，NaCl 1.0 g/L，琼脂 18.0 g，pH 7.2）上重复划线来选择和纯化黄色菌落（SYSU D00978T）。纯化的菌株在-80 °C 下保存为甘油原液 （25 %，v/v），在 4 °C 下保存为冻干奶管 （10 %，m/v）。\n使用 E.Z.N.A.® 细菌 DNA 试剂盒从纯化培养生物质中提取菌株 SYSU D00978T 的基因组 DNA，使用16S rRNA基因进行扩增和测序，使用ContEst16S 算法从草图基因组中提取完整的16S rRNA基因序列（1521 bp）。\n在北京基因组研究所，使用 Illumina NovaSeq 6000 平台对菌株 SYSU D00978T 进行了全基因组测序，使用 Fastp（v0.23.2）对原始读取进行修剪以去除低质量碱基，并使用工具 SPAdes （v3.15）组装产生的高质量序列。\n基因组原始测序数据及高质量基因组数据已上传至NCBI数据库，项目号为PRJNA699703，基因组登录号为JAFIQW000000000.1。
", "ds_quality": "", "ds_acq_start_time": "2021-03-25 00:00:00", "ds_acq_end_time": "2021-03-25 00:00:00", "ds_acq_place": "新疆古尔班通古特沙漠（北纬44°56′，东经88°33′，海拔 654 m）", "ds_acq_lon_east": null, "ds_acq_lat_south": null, "ds_acq_lon_west": null, "ds_acq_lat_north": null, "ds_acq_alt_low": null, "ds_acq_alt_high": null, "ds_share_type": "open-access", "ds_total_size": 725200741, "ds_files_count": 3, "ds_format": "gz和fasta文件", "ds_space_res": null, "ds_time_res": "", "ds_coordinate": "无", "ds_projection": "无", "ds_thumbnail": "89b3ce23-e921-41d0-a765-d544f2371558.png", "ds_thumb_from": 0, "ds_ref_way": "", "paper_ref_way": "", "ds_ref_instruction": "", "ds_from_station": null, "organization_id": "a5877b42-96ea-4f13-af7e-246f355413d6", "doi_value": "", "subject_codes": [ "180.61" ], "quality_level": 1, "publish_time": "2026-06-22 12:59:37", "first_publish_time": null, "last_updated": "2026-06-22 12:59:37", "protected": false, "protected_to": null, "lang": "zh", "cstr": "33110.11.ariddc.01447", "license": null, "extra": null, "files_shape": [ { "name": "基因组测序文件", "size": null, "is_dir": true }, { "name": "基因组组装文件", "size": null, "is_dir": true } ], "features": null, "data_level": 0, "ds_topic_tags": [ "土壤", "菌株", "基因" ], "ds_subject_tags": [ "微生物学" ], "ds_class_tags": [], "ds_locus_tags": [ "新疆古尔班通古特沙漠（北纬44°56′，东经88°33′，海拔 654 m）" ], "ds_time_tags": [ 2021 ], "ds_contributors": [ "李帅" ], "ds_meta_authors": [ "李帅" ], "ds_managers": [ "李帅" ], "category": "土壤" }